Daop (Daerah Operasi) 1 ada di Stasiun Gambir, Pasar Senen dan Stasiun Bekasi. Daop 2 di Stasiun Bandung dan Kiaracondong sedangka wilayah Daop 3 layanan pemeriksaan GeNose ada di Stasiun Cirebon dan Cirebon Prujakan.
Wilayah Daop 4 layanan pemeriksaan terdapat di Stasiun Semarang Tawang, Semarang Poncol dan Stasiun Tegal. Untuk Daop 5 layanan GeNose di Stasiun Purwokerto dan Kutoarjo.
Untuk wilayah Daop 6, pelayanan di Stasiun Yogyakarta, Solo Balapan dan Lempuyangan sedangkan Daop 7 di Stasiun Madiun dan Jombang.***